南京地铁是可以用支付宝的，2018年12月25日，支付宝官微宣布，从26日起，南京地铁正式开通支付宝扫码支付功能，全线174个车站每站“两进两出”闸机通道投入使用。截止2019年6月，南京地铁仅支持银联闪付和支付宝二维码两种移动支付方式。
南京支付宝扫码乘坐地跌的具体步骤如下：
1、领卡流程：进入支付宝首页，点击顶部的”付钱”→点击底部的”乘车码”→点击底部的”切换卡片”→定位”所在城市”，并”领取”南京地铁电子卡→点击”立即领卡”按钮→在”支付宝授权领卡页”，点击”确认并授权”→领卡成功。
2、使用流程：进入支付宝首页，点击顶部的”付钱”→点击底部的”乘车码”→将二维码对准闸机橙黄色模块”扫码区”。
截止2019年6月，包括南京地铁在内的全国120个城市公交、地铁都使用了支付宝首创的双离线二维码技术。在网络较差的情况下，也能保证用户最快0.3秒高速过闸。随着南京地铁刷码坐车上线，明年有望实现长三角地铁刷码互联互通，南京人一个手机就能畅行长三角。