利率的风险结构是指具有相同的到期期限但是具有不同违约风险、流动性和税收条件的金融工具收益率之间的相互关系。多数情况下具有较低的流动性。
债务人无法依约付息或归还本金的风险称为违约风险，它影响着债权工具的利率。各种债权工具都存在着违约风险，公司债券的利率往往高于同等条件下的政府债券的利率，普通公司债券的违约风险比信用等级较高的公司债券的违约风险要大。一般来说，债券违约风险越大，其利率越高。
影响债权工具利率的另一个重要因素是债券的流动性。流动性是指资产能够以一个合理的价格顺利变现的能力，它是一种投资的时间尺度(卖出它所需多长时间)和价格尺度(与公平市场价格相比的折扣)之间的关系。各种债券工具由于交易费用、偿还期限、是否可转换等条件的不同，变现所需要的时间或成本也不同，流动性就不同。一般来说，国债的流动性强于公司债券；期限较长的债券，流动性较差。流动性较差的债券，风险相对较大，利率定得就高一些；反之亦然。
所得税也是影响利率风险结构的重要因素。在同等条件下，具有免税特征的债券利率要低。在美国，市政债券的违约风险高于国债，流动性低于国债，但由于市政债券的利息收入是免税的，所以长期以来，美国市政债券的利率低于国债的利率。