银行存管是由银行管理资金，平台管理交易，做到资金与交易的分离，使得平台无法直接接触资金，资金存管最初是在证券行业中诞生的。用户进行证券交易的资金，一开始是由证券公司在银行建立一个账户直接管理，但这样存在很大的风险，因为证券公司可以直接挪用用户的资金，而没有任何束缚。
后来，监管层要求客户资金必须统一由商业银行存管。在这种存管模式下，证券公司只负责客户证券交易的管理，资金结算与管理由银行负责。需要重点注意的是，为防范券商虚构交易，挪用客户资金，银行能够同时根据证券登记公司的交易结算数据和券商的证券交易、股份管理数据进行核对，避免用户资金被挪用的可能性。
该制度有效地在证券公司与客户资金间建立了隔离。也就是说，每一笔资金的流动，是有真实的证券交易背景的，并有数据纪录，银行可以核对数据。存管银行，指按照《证券法》的要求，接受券商及其客户的委托，提供客户证券交易保证金存管服务的商业银行。
银行存管是由银行管理资金，平台管理交易，做到资金与交易的分离，使得平台无法直接接触资金，避免客户资金被直接挪用。在第三方存管模式下，存管银行提供的服务有：管理客户交易结算资金管理账户、管理客户交易结算资金汇总账户、交易结算资金存取服务。