国家基因组科学数据中心公开新型冠状病毒全基因组序列

国家基因组科学数据中心公开新型冠状病毒全基因组序列

澎湃新闻记者 贺梨萍

国家基因组科学数据中心(NGDC)信息显示,1月26日,该中心收录了由中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所提供的5株2019新型冠状病毒全基因组序列。

这是自2019年12月该病爆发以来,国内公共数据平台首次公开发布数据。此前科学家陆续获得的2019新型冠状病毒基因组序列一般递交到全球流感序列数据库(GISAID)和美国国家生物技术信息中心(NCBI)的GenBank数据库。

国家基因组科学数据中心公开新型冠状病毒全基因组序列

此前的1月22日,国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒信息库。该库整合了世界卫生组织(WHO)、中国疾病预防控制中心(CDC)、美国国家生物技术信息中心、全球流感序列数据库等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时,对不同冠状病毒株的基因组序列做了变异分析与展示。

2019新型冠状病毒信息库基于不同参考基因组序列开展2019-nCoV病毒株基因组变异分析,并对结果进行了统计与可视化展示。通过对全基因组序列相似性比较和变异位点分析,获取2019-nCoV病毒株之间、2019-nCoV病毒株与SARS冠状病毒以及与类SARS冠状病毒蝙蝠株之间的变异程度、变异区域、变异碱基的详细信息。

对2019-nCoV病毒株的基因组变异分析为追溯病毒来源、追踪病毒株变异路径、防控新型冠状病毒引发的疫情、治疗病毒性肺炎提供重要的数据基础与决策支持。

上述资源库发布之际,中科院北京基因组所研究员、国家基因组科学数据中心主任鲍一明在接受《中国科学报》采访时曾表示,“我们这个数据库发布以后,就有单位联系要将武汉新型冠状病毒基因组的数据送到这儿来,而不是先到国外然后国内研究人员再去拿回来‘出口转内销’了。”

国家基因组科学数据中心介绍,冠状病毒属于套式病毒目、冠状病毒科、冠状病毒属,是一类具有囊膜、基因组为线性单股正链的RNA病毒,是自然界广泛存在的一大类病毒。某些冠状病毒会感染人类并引起疾病,比如中东呼吸综合征(MERS)和严重急性呼吸综合征(SARS),其症状可从普通感冒到重症肺部感染。

Published by

风君子

独自遨游何稽首 揭天掀地慰生平

发表回复

您的电子邮箱地址不会被公开。 必填项已用 * 标注