点击开始游戏，进入更多选项，分别有从头开始，继续游戏，选择已过章节，在底端还有设置功能，退出选项。图中包含，音量，人物音量，背景音效，文字显示速度，准星移动速度，移动画面摇动效果，操作上下视角，水平视角等多个选项，玩家可按个人习惯进行各项设置。当人物获得技能后，在室外遇到浣熊控制的机甲可进行瞄准攻击。图中左上角是人物所在区域显示，右上角是人物血量显示，左下角有移动方式提醒。
对话时的界面与自由界面基本一致，操作略有不同。此时按下R1可以自动播放人物对话，按下L1可以隐藏图中UI面板（对话框、状态图标等等），按下B可以快进，推动右摇杆可以触发Reaction Voice,可进行或好意或敌意或肯定或否定的回答。
按F1（手柄X键）可打开手册面板，在这里玩家可以查看或打开地图、言弹、礼物、羁绊、校规、设置选单。打开手册中的地图可查看校园内大地图，并进行个别地点的瞬移。当然，自由探索时也可以按下Y键查看透明大地图（不妨碍移动）。言弹即是玩家在非日常篇时期进行探索调查获得的证物亦或是证词。
手册内的礼物栏可以查看纪念品礼物或者可送出的礼物。在手册中的通讯簿内可查看16名已结识的超高中级角色信息。在手册里面点击校规，可以查看才囚学园的校规。在手册里面的设置选单可进行相应的设置。还要注意黄字是弱点，可用言弹击破（若在出现黄字时按R1即可看到红色的V点，此时以言弹击破便可发动V驳倒）