扣非亏损就是指：扣除非经常性损益后的净利润为负数的上市公司。非经营性损益是指不是经常性发生的，和公司主营业务无直接联系的收入或支出。如扣除：公司变卖资产所得、政府补贴所得等款项。
比如：某公司净利润有1亿万，但是这1亿万中，有1000万是由于公司土地被征收，因此属于政府补助款项，所以这1000万属于非经常性损益，则需要在净利润中扣除。
根据最新的退市制度，扣除经常性损益后，如果公司净利润为负且营业收入为负数，连续两年则会被退市。
监管机构新增这一条新规，是因为：很多企业在连续亏损两年后达到退市要求，但公司变卖固定资产然后将净利润变成正数，这样就不用退市。而新规后，就不允许这样的情况出现，淘汰一些垃圾股。