增值税专用发票分为三联和六联两种，六联与三联相比多出三联，这三联是没有指定用途的，多出的三联是纳税人根据自己的需要来决定用途，一般都是三联，记账联，发票联和抵扣联。有些单位有特殊要求的，或者税务机关代开的要留底之类的，才使用六联。
第一联为发票联，购货方记账；第二联为抵扣联，购货方作抵扣税款凭证；第三联为记账联，售纲方记账用。从纳税人实际需要出发，国家税务总局还印有六联版专用发票，其中1-3联仍为基本联次，4-6联根据纳税人实际需要使用，全国不作统一规定，也就是说后三联可用做提货联存根联等等。可以使用六联的发票的。其他联次用途，由一般纳税人自行确定。