微粒贷最晚在还款日当日晚24点前进行，超出这个时间的将会算作逾期。微粒贷在还款日0点-12点、17点到21点进行两次自动扣款，错过自动扣款的，则应在当日24点前进行手动还款，否则即为逾期。微粒贷发生逾期不仅会上报征信系统，且要收取一定的逾期费用。
微粒贷官方表示，只要在还款日第二天24点前还款成功，个人信用将不会受到影响，这相当于微粒贷有1天的还款宽限期，而若超过这个期限仍没有还清欠款的则逾期信息会上报征信，并产生逾期罚息。逾期罚息的费率为自逾期之日起，每天对逾期本金额外收取约定利率50%的罚息，直至逾期还清。具体以微粒贷页面显示的为准。