微信和支付宝两个健康码都是一样的，，从定位上来说支付宝的健康码是国家一级的，因为支付宝在国务院办公厅电子政务办指导下建立全国统一的疫情防控健康码系统。
而微信主要是与国家信息中心联合推出“健康码”的标准，并非建立全国统一的健康码系统，所以相比较而言支付宝定位更高。但是两者效用是一样的，可以通过支付宝也可以通过微信申领自己的健康码。但腾讯今后又在国家信息中心指导下联合各方推出不限于疫情防控的公益性建设工程：“数据长城”计划，持续助力国家现代化建设。
健康码是证明自己身体健康状况的电子通行凭证，省却了手工纸质开具证明的麻烦，实现简单的二维码通行模式。由本人通过网上执行申报，经过后台审核后，生产属于自己可以在本地区出入通行的电子凭证，一次申报全市通用。